Sveobuhvatna je politika EU prema Bosni i Hercegovini obilježena nastavkom značajnog angažmana u okviru CFSP-a, te vojnih i civilnih instrumenata Evropske sigurnosne i odbrambene politike (ESDP). Zajedničkom akcijom Vijeća Europske unije, od 30. januara 2006. godine, imenovan je novi specijalni predstavnik (EUSR) Evropske unije, sa mandatom do kraja februara 2007. godine. Odlukom Vijeća EU dodatno je ojačana uloga EUSR u koordinaciji svih instrumenata EU u BiH. Imajući u vidu da je EUSR istovremeno i Visoki predstavnik za provođenje (HR) Okvirnog mirovnog sporazuma za BiH (Dayton/Paris Agreement), očekuje se njegova značajna uloga u najavljenom okončanju mandata OHR-a, u skladu sa principijelno izraženom spremnošću Vijeća EU da preuzme ovu misiju.
Vijeće EU je na sastanku održanom 18. o6. 2007. godine u Luksemburgu donijelo odluku o imenovanju Miroslava Lajčaka za specijalnog predstavnika EU u BiH (EUSR) za period od 1. 07. 2007. godine do 29. 02. 2008. godine.
Mandat Policijskoj misiji EU u BiH (EUPM) je Zajedničkom akcijom Vijeća EU od 19.11.2007. godine produžen do 31.12.2009. godine (Misija je pokrenuta 2003. godine). Policijska misija EU u BiH je usmjerena ka stvaranju održive, profesionalne i multietničke policijske strukture, koja djeluje u skladu sa međunarodnim standardima. Misija djeluje u koordinaciji sa i pod političkim vodstvom specijalnog predstavnika EU u BiH, kao dio pristupa šire vladavine zakona u BiH i u regiji.
Vojna operacija Evropske unije u BiH (EUFOR/Althea) dio je koherentnog pristupa EU i ima zadatak kontinuiranog praćenja pridržavanja odredaba Okvirnog mirovnog sporazuma za BiH i doprinosi učvršćivanju sigurnosti u BiH. Misija Althea značajno doprinosi sveukupnom političkom angažmanu EU i njenim programima pomoći za BiH. Na osnovu plana tranzicije u 2007. godini, snage EU (EUFOR) će zadržati oko 2.500 vojnika u BiH, sposobnih da reaguju ukoliko sigurnosna situacija to bude zahtijevala.